據媒體報道，“神七”的指揮團隊有五人，呈“一正四副”格局，總指揮由中央軍委委員、解放軍總裝備部部長常萬全擔任。

　　四名副總指揮分別為總裝備部副部長張建啟中將、中國航天科技集團總經理馬興瑞、中國科學院副院長江綿恒、國防科工局副局長兼國家航天局局長孫來燕。其中后二人是“神六”指揮班子成員。

　　張建啟中將被認為是中國軍隊中最精通航天技術和核工業(yè)的高級將領之一，據了解，他是統(tǒng)籌“神七”工作的主要負責人和常務副總指揮，在總裝備部四位副部長中分管航天工作。“神七”飛船運抵酒泉等各項主要活動，均由其牽頭。

　　馬興瑞在指揮團隊里主要負責“神舟”飛船和火箭的研制。49歲的馬興瑞是中國航天界的少帥之一，先后擔任過實踐五號衛(wèi)星總指揮和總設計師、繞月探測工程副總指揮、總裝衛(wèi)星系統(tǒng)技術專業(yè)組組長。他是國際宇航科學院院士，擁有多項國家科技大獎。